سؤال مشكلة مع جهاز تسلسل الحمض النووي


لقد حصلت مؤخراً على جهاز التسلسل الجيني (DNA) لـ Minion USB ، والذي لا يبدو لي أنه يعمل في أوبونتو بشكل صحيح.

أنا أستخدم الإصدار 12.04 من Ubuntu. يتم اكتشاف جهاز التسلسل بشكل صحيح بواسطة البرنامج النصي / برنامج التشغيل الذي يأتي معه ، ولكن يبدو أنه غير قادر على اكتشاف العينة.

أرفق لقطة الشاشة للعملية. أي مساعدة سيكون موضع تقدير كبير!

enter image description here


11
2018-06-11 14:19


الأصل


حاول تشغيل برنامج تجميع البرنامج النصي / العينة كجذر gksu - hexafraction
هل يقوم الجهاز بإلقاء بعض الرسائل المفيدة على / var / log / syslog أو شيء ما؟ - Christian


الأجوبة:


عندما يكتشف البرنامج أن الجهاز قد تم اكتشافه بشكل صحيح ، يبدو أنه من المحتمل أن تكون مشكلتك في جانب جهاز التسلسل الجيني ، بدلاً من كونها مشكلة أوبونتو. هل هناك أي أدوات مساعدة أخرى تسمح لك بالتواصل مع جهاز التسلسل لأية ميزات أخرى ، ربما روتين معايرة؟ إذا كان بإمكان Ubuntu التواصل مع الماكينة والحصول عليها للقيام بأشياء أخرى ، فإنني أتوقع أن تكون المشكلة مع جهاز تثبيت الجينات بدلاً من الكمبيوتر. اختبار آخر محتمل هو محاولة استخدام نظام تشغيل آخر ، إذا كان هناك برنامج متوفر. أخيرًا ، تأكد من أن جهاز التسلسل يحتوي على أحدث البرامج الثابتة ، وأن البرنامج الذي تستخدمه للاتصال محدث.


2
2018-06-14 12:17



هناك شيء آخر سأفكر بشأنه ، أي أن تشغيله من القشرة قد لا يعطي أكبر قدر من الأولوية. هذا هو أكسفورد nanopore sequencer الذي يحتاج إلى مصادقة كاملة قبل أن يسمح لأحد على شبكتها. ليس لديه معلومات كافية لتشغيل والوصول إلى العينة - هذا ما أعتقده. - all4naija
هذا هو جهاز تسلسل الحمض النووي ذاتيا. من الأرجح أن تكون الواجهة عبارة عن محول منفذ تسلسلي USB عادي والذي يتحدث عنه النص البرمجي - والذي يبدو أنه يعمل بشكل صحيح. أوافق على أن المشكلة ربما تكون مع نهاية التسلسل للأشياء ، وليس الواجهة مع الكمبيوتر. Gridion ليست منصة "الحوسبة السحابية" ، إنها مجموعة متوازية من متواليات الجينات للوظائف الأكبر. - Adrian
للمزيد من المعلومات: nanoporetech.com/technology/the-gridion-system/... - all4naija


تخمين متوحش: هل يمكن أن تكون مشكلة أذونات؟ تعمل بعض الأجهزة على ما يرام لبعض العمليات عند تشغيلها كمستخدم عادي ، ولكنها تتطلب ذلك root امتيازات لأداء العمليات الأخرى. وبالتالي ، قد تحاول sudo ./gseq ومعرفة ما إذا كان ذلك يساعد. إذا كان ذلك يساعد ولكنك لا تريد أن تعمل كما root طوال الوقت ، يمكنك تعقب ملف (ملفات) الجهاز وتغيير أذوناته لمنح نفسك إمكانية الوصول إلى الجهاز باستخدام حسابك العادي. هذا من المحتمل أن ينطوي على إنشاء قواعد udev. لن أذهب إلى هذا هنا لأن هذا الحل هو لقطة طويلة.


1
2018-06-15 04:40





هل من الممكن أن يتم تجاوز عمر 6 ساعات للجهاز؟ يبدو من المرجح أنه أكثر من خطأ في الجهاز أو مشكلة في العملية. من المحتمل أن يكون الدعم الفني من Minion هو جهة الاتصال الرئيسية لحل هذه المشكلة حيث يبدو أن البرنامج يتواصل مع الجهاز.

كريس


0
2018-06-19 03:16